Создание Академии государственной безопасности имени Гейдара Алиева для органов безопасности, одного из важных государственных учреждений независимой Азербайджанской Республики, которая будет достойно служить народу и государству, защищать его безопасность, воспитывать лояльных и патриотичных, новое поколение профессиональных и квалифицированных кадров напрямую связано с именем общенационального лидера Гейдара 

Алиева. Наш великий лидер, посвятивший 25 лет своей богатой и значимой жизни служению в органах государственной безопасности еще 28 марта 1997 г. выступая на совещании, посвященном созданию профессионального праздника для сотрудников службы безопасности говоря о роли персонала, служащего в этих органах, о потребностях и факторах, которые их характеризуют, он отметил необходимость создания специального высшего учебного заведения для подготовки высококвалифицированных, профессиональных национальных кадров.

Прошедший период был богат на ряд исторических событий для Академии, которые не будут стерты из памяти.Так, Академия была названа в честь общенационального лидера Гейдара Алиева Указом, подписанным Президентом Азербайджанской Республики Ильхамом Алиевым 20 декабря 2005 года, с учетом достижений в области подготовки кадров для силовых структур.27 марта 2006 года Президент Азербайджанской Республики, Верховный Главнокомандующий Вооруженными Силами Ильхам Алиев посетил Академию и открыл великолепный памятник общенациональному лидеру Гейдару Алиеву, музей «Слава»,  с уникальным содержанием и элегантным дизайном и лично преподнес академии «боевой флаг», который является символом мужества.

10-я годовщина создания Академии была торжественно отмечена в декабре 2008 года, 15-летие - в декабре 2013 года, а 20-летие - в декабре 2018 года.

Академия установила взаимовыгодные отношения сотрудничества, основанные на деловых отношениях с вузами и международными организациями спецслужб республики, а также стран-партнеров.